На границах страны ветра есть одно место, руины, которые зовутся Роураном. В недалеком прошлом, лет двадцать назад, вместо руин был огромный город посреди пустыни. Сейчас же там много метров песка, а за ними одна башня. Дело в том, что под Роураном хранится очень могущественная сила - Риомьяку. Это сила выражается в бесконечной чакре и может натворить много бед. Когда четвертый Хокаге был жив, он с помощью своих техник запечатал эту силу и весь город. Недавно, из Деревни Скрытой в Песке сбежал ниндзя отступник - Мукаде. Он хочет завладеть этой силой и подчинить пять великих наций с помощью своих марионеток. Коноха решила помочь союзникам в поимке злодея. Хокаге дала задание Наруто, Сакуре, Саю и Ямато, найти и ликвидировать Мукаде.
Когда они его нашли было уже слишком поздно. Мукаде смог поглотить печать четвертого, но получил не то что ожидал. При поглощение активировалась межпространственная техника и Наруто вместе с Мукаде переместились в прошлое. Наруто очнулся в незнакомом месте и решил оглядеться. На него напали неизвестные марионетки и его спас отряд из Конохи. Он состоял из Минато, отца Чоуджи и отца Шино Абураме. Они объяснили ему что это за место. Так же Наруто познакомился с местной принцессой и от нее он узнал, что 6 лет назад к ним прибыл человек из будущего - Анро Кузан и уговорил королеву Роурана освободить силу Риомьяку, чтобы сделать город лучше. После чего он убил ее и в тайне от наследницы заменял людей города марионетками. Теперь Наруто предстоит избавится от этого типа, снова запечатать силу Риомьяку и вернутся назад в будущие.